Dans un futur lointain, l'espèce humaine a disparu de la surface de la Terre. Si la cause de sa disparition (ou peut-être de son trépas) est inconnue, une autre espèce dotée d'une conscience n'a pas tardé à remplir le vide laissé par cette absence. Génération après génération, une espèce de modestes abeilles a évolué jusqu'à prendre la place des humains. Au fil des années, les Melliferas ont vu leur taille et leur intelligence s'accroître, ce qui leur a permis de former une société aujourd'hui très développée.

Dans Apiary, chaque joueur contrôle une des 20 factions uniques. Chaque faction commence la partie avec seulement une ruche, quelques ressources et des abeilles ouvrières. Optimisez le placement de vos ouvriers et la construction de votre ruche pour développer votre société. Une année d'influx bien chargée vous attend.... Explorez des planètes, amassez des ressources, développez des technologies et sculptez des monuments, puissance de votre faction (mesurée en points de victoire). Mais prenez garde, le Néant n'est pas bien loin, et vos ouvriers n'ont que quelques actions à disposition avant d'être contraints à hiberner.

Le défi est immense et surdimensionné ramené à la taille de vos congénère. Parviendrez-vous à prospérer ou vous contenterez-vous de survivre?